آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین و پیش‌بینی پروتئین‌های کلیدی در اسنیتوباکتر بومانی به منظور شناسایی پروتئین های هدف در دارو درمانی
مجری طرح: دکتر سارا مینائیان، همکاران طرح: فاطمه سجادی،سهیل رحمانی فرد،
اسنیتوباکتربومانی یک باکتری گرم منفی است و به عنوان یک پاتوژن مهم بیمارستانی در سطح جهان ظاهر شده است. این باکتری دائماً در حال یافتن راه های جدیدی برای جلوگیری از اثرات آنتی بیوتیک ها و مقاومت در برابر آن ها می باشد. امروزه مقاومت میکروبی به طور فزاینده ای نسبت به اسنیتوباکتر ایجاد شده است. از این جهت شناسایی و معرفی اهداف دارویی جدید می تواند در کنترل عفونت ناشی از مقاومت دارویی موثر باشد.
با تجزیه و تحلیل برخی از ویژگی های توپولوژیکی شبکهی برهمکنش پروتئین-پروتئین اسنیتوباکتر و شناسایی پروتئین های کلیدی آن، ممکن است بتوان پروتئین هایی را برای اهداف دارویی جدید بالقوه در این بیماری پیشنهاد کرد. در این پژوهش محاسباتی و بیوانفورماتیکی، داده‌های بیانی پروتئین/ژن از مقالاتی که روی پروتئوم اسنیتوباکتر بومانی متمرکز شده بودند استخراج شد. شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین با استفاده از نرم افزار ساخته شد و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.
بر اساس آنالیز هستی شناسی ژن، اکثر پروتئین های اسنیتوباکتر بومانی در مسیرهای متابولیکی و سنتز ریبوزوم نقش دارند.نتایج نشان داد که 3 پروتئین هاب-گلوگاه شناشایی شده، نقش مهمی در پاتوژنز و مقاومت دارویی اسنیتو باکتر بومانی دارند. همچنین 6 پروتئین seed می توانند به عنوان کاندیدای بالقوه به عنوان نشانگرهای زیستی و نیز اهداف دارویی جدید در نظر گرفته شود. با این حال، تحقیقات بیشتری برای ارزیابی جزئیات این پروتئین ها مورد نیاز است.